Le milieu de terrain était arrivé à Zurich en 2005 en provenance de Neuchâtel Xamax. En 2007, son expérience en Liga à Osasuna Pampelune s'était terminée par une rupture des ligaments croisés. De retour dans l'entrejeu du FCZ depuis 2009, Margairaz était l'un des piliers d'Urs Fischer depuis deux saisons. En 198 matches avec l'actuel 7e du championnat, l'ancien joueur de Lausanne-Sport a inscrit 50 buts dont notamment un penalty face au Real Madrid en Ligue des champions en 2009.
Margairaz au FCZ c'est aussi trois titres de champion d'Axpo Super League et une victoire en Coupe de Suisse. En quittant Zurich pour Sion, le Vaudois se retrouvera dernier au classement, à 21 points de son ancien club.
Pour remplacer le départ de Margairaz, le club du Letzigrund accueille le Monténégrin Asmir Kajevic (21 ans). En provenance du FK BSK Borca en première division serbe, la nouvelle recrue zurichoise a signé un contrat jusqu'en juin 2012 avec option pour une prolongation jusqu'en 2015.
Le FC Zurich annonce également l'arrivée du défenseur central Rafael Ramazotti De Quadros (23 ans) en provenance de l'Avispa Furuoka (D1 japonaise). Le Brésilien, qui a notamment appartenu au club brésilien de Palmeiras à l'âge de 17 ans, a également paraphé un accord qui le lie au club d'Ancillo Canepa jusqu'à la fin de la saison avec option pour une prolongation jusqu'en 2015.